ToPaMIn — UR 3075 — Laboratoire

Toxoplasma, Parasitic and Mycotic Infections

Sous la direction de Alexander Pfaff

    Présentation

    Notre unité est constituée d’enseignants-chercheurs hospitalo-universitaires appartenant au Laboratoire de parasitologie et de mycologie médicale, ainsi que des cliniciens du service d’Ophtalmologie des Hôpitaux universitaires de Strasbourg. Notre activité comporte un volet de recherche translationnelle sur la thématique de la toxoplasmose oculaire, mais également une activité de recherche clinique, étroitement liée à notre activité hospitalière, sur les thématiques de la toxoplasmose, d’autres parasitoses et de la mycologie médicale. Notre laboratoire est centre associé du Centre national de référence (CNR) de la toxoplasmose.

    Thématiques – Axes de recherche

    Axe 1 : Recherche translationnelle sur la toxoplasmose oculaire

    L’équipe s’intéresse aux mécanismes immunitaires innés impliqués dans la toxoplasmose oculaire. Notre projet se focalise sur la réponse immunitaire suite à une toxoplasmose oculaire dans une approche translationnelle, entre modèles in vitro, in vivo chez la souris, et les études cliniques. Ceci permet une étude complémentaire des facteurs d’intérêt étudiés. 

    Nos études récentes se sont focalisées sur les rôles des interférons de type I et III dans la régulation de la barrière hémato-rétinienne, ainsi que sur la régulation d’un facteur central du contrôle immunitaire dans la toxoplasmose oculaire (PD-L1). 

    La stratégie de cet axe consiste à identifier de nouveaux facteurs immunologiques régulant une toxoplasmose oculaire.

    Il existe de nombreuses souches de Toxoplasma gondii, avec des traits de virulences très variés. C’est surtout en Amérique du Sud que l’on observe des souches qui provoquent des pathologies sévères. L’objectif de notre recherche est donc aussi de comparer l’expression des facteurs d’immunomodulation induits par des souches choisies pour leur impact clinique observé. Les résultats pourraient permettre de distinguer une infection plus sévère par la signature de l’expression des cytokines et des récepteurs d’immunomodulation.

    Nos résultats récents ont montré que l’expression dans les cellules rétiniennes de certains facteurs immuno-régulateurs est modifiée par la présence du parasite, et plus exactement, par la présence de facteurs secrétés par le parasite. Selon nos données, des protéases, probablement parasitaires, sont impliquées dans ce processus. Nos collègues du CHU de Reims ont décrit des métallo-protéases de T. gondii. Nous utiliserons cette collaboration pour continuer d’étudier l’effet des protéases les plus prometteuses sur la régulation immunologique dans nos modèles de toxoplasmose oculaire in vitro et in vivo chez la souris.

    Axe 2 : Recherche Clinique en Parasitologie

    A) Marqueurs de l’épuisement des cellules immunitaire chez les patients présentant une toxoplasmose oculaire

    Pour des raisons inconnues, certains individus immunocompétents infectés par T. gondii présentent des réactivations de l’infection latente oculaire. Les traitements actuels ne réduisent pas le risque de récurrence. Nous prévoyons une étude afin d’identifier des marqueurs immunologiques d’épuisement dans le sang périphérique des patients atteints d’une toxoplasmose oculaire, et de comparer leurs profils aux patients infectés par Toxoplasma, mais sans lésions rétiniennes.

    B) Biomarqueurs comme outil diagnostique dans la toxoplasmose 

    Notre activité dans cadre du Centre national de référence (CNR) de la toxoplasmose nous amène régulièrement à effectuer ou à participer aux études d’identification de biomarqueurs cliniques comme outils de diagnostic ou d’estimation du pronostic des patients.

    Collaboration en tant que laboratoire support du pôle « Biologie moléculaire » du CNR de la toxoplasmose : cette collaboration vise à évaluer les dispositifs médicaux de diagnostic in vitro disponibles sur le marché ; à mener des études de pratiques, associées ou pas à des collectes de cas, afin d’émettre des conseils et des recommandations au regard des question actuelles que se posent les professionnels de la biologie médicale.

    C) Parasitologie

    Notre activité porte essentiellement sur le développement et l’évaluation de nouveaux outils de diagnostic biologique des parasitoses humaines (échin coccoses, anguillulose, parasitoses intestinales) et sur l’amélioration de la prise en charge des patients (microsporidioses).

    D) Mycologie médicale

    L’activité d’expertise et la recherche clinique sont indissociables de l’activité diagnostique en CHU. Notre laboratoire est centre associé du CNR des mycoses invasives et antifongiques de l’Institut Pasteur, et du du CNR des aspergilloses chroniques. Nous participons à des études épidémiologiques multicentriques de large envergure ayant pour objectif de développer les connaissances sur des infections invasives, rares et émergente, ou les modalités de prise en charge thérapeutique complexes. Nous sommes co-investigateur dans des études cliniques et biocliniques nationales ou européennes portant sur l'évaluation de nouvelles thérapeutiques ou sur l'établissement de nouvelles stratégies diagnostiques.

    Événements et travaux d'envergure

    Co-organisateur (A. PFAFF) du Séminaire de microbiologie de Strasbourg (SMS), événement annuel qui donne la possibilité aux étudiants en Master et en thèse de science, ainsi qu’aux jeunes chercheurs strasbourgeois, de présenter leurs travaux de recherche.

    Reconnaissances et distinctions

    Les membres de l’unité font partie d’institutions et de sociétés savantes nationales et internationales reconnues. 

    Obtention régulière des bourses de la Fondation de France (Bourse Berthe Fouassier) pour des thèses et des Master 2.

    Obtention d’un financement Appel à projets jeunes chercheurs (APJ) (2016-2018) : Étude des variations d’expression clinique et biologique des récurrences toxoplasmiques chez les patients atteints de toxoplasmose oculaire et l’implication de la susceptibilité génétique individuelle de chaque patient (TREXO).

    Publications :

    Toxoplasmosis

    Parasitologie

    • Kaurin J, Gerber V, Brunet J, Demiselle J (2024): Bronchoalveolar lavage highlighting an unusual cause of ards: Strongyloides stercoralis. Intensive Care Med 50(2):296-298.
    • Gerber V, Ruch Y, Chamaraux-Tran TN, Oulehri W, Schneider F, Lindner V, Greigert V, Denis J, Brunet J, Danion F (2021): Detection of Pneumocystis jirovecii in patients with severe covid-19: Diagnostic and therapeutic challenges. J Fungi 7(8).
    • Gerber V, Le Govic Y, Ramade C, Chemla C, Hamane S, Desoubeaux G, Durieux MF, Degeilh B, Abou-Bacar A, Pfaff AW, Candolfi E et al (2021): Ancylostoma ceylanicum as the second most frequent hookworm species isolated in France in travellers returning from tropical areas. J Travel Med 28(6).
    • Nourrisson C, Brunet J, Flori P, Moniot M, Bonnin V, Delbac F, Poirier P (2020): Comparison of DNA extraction methods and real-time PCR assays for the detection of Blastocystis sp. in stool specimens. Microorganisms 8(11).
    • Martinot M, Abou-Bacar A, Lamothe M, Tebacher MA, Zadeh MM, Dalle F, Favennec L, Costa D, Brunet J, Sellal F (2020): Cryptosporidiosis after treatment with fingolimod: A case report and pharmacovigilance review. Bmc Infect Dis 20(1).

    Mycologie

    • Pasquier G, Harmand P-O, Le Feur L, Guemas E, Bellanger AP, Maubon D, Favel A, Cottrel C, Hasseine L, Sabou M, Dannaoui E, Fekkar A, Normand A-C, Gangneux J-P, Delhaes L, Sasso M, Lachaud L. (2026): Antifungal susceptibility and molecular characterization of clinical and environmental isolates of Schizophyllum commune. J Clin Microbiol. 2026 Feb 18:e0144225.
    • Novy E, Schaeffer A, Nguyen M, Dalle F, Pottecher J, Letscher-Bru V, Louis G, Stephan C, Luc A, Machouart M, Debourgogne A. (2026): Analytical performance of species-targeted quantitative PCR for intra-abdominal candidiasis in critically ill patients: a proof-of-concept post hoc analysis from the pBDG2 multicenter study. Crit Care. 2026 Feb 10.
    • Hoellinger B, Epailly E, Vuotto F, Letscher-Bru V, Loridant S, Goeminne C, Coelho R, Laurent G, Guendouz S, Melica G, Botterel F, Maubon D, Boignard A, Pattier S, Morio F, Chabanne C, Gangneux JP, Blanchart K, Bonhomme J, Grosjean S, Dalle F, Nafeh-Bizet C, Favennec L, Pilmis B, Guihaire J, Gigandon A, Pasquier G, Dupasquier V, Vignals C, Lefranc M, Tirard-Collet P, Sebbag L, Van Den Bogaart L, Lanternier F, Saito M, Danion F. (2026): Invasive mold infection in heart transplant recipients: A nationwide multicenter matched case-control study between 2008 and 2022 in France. Am J Transplant. 2026 Jan 29:S1600-6135(26)00042-0.
    • de La Porte C, Provost C, Coste A, Herbrecht R, Denis B, Canet E, Ader F, Lelièvre L, Pansu N, Haouy S, Chantelot L, Chouaki T, Lambert J, Verillaud B, Braun T, Tantet C, Risso K, Tattevin P, Vuotto F, Michot JM, Pourcher V, Bougnoux ME, Letscher-Bru V, Alanio A, Morio F, Persat F, Cassaing S, Bourgeois N, Lachaud L, Hasseine L, Botterel F, Delhaes L, Imbert S, Bonhomme J, Gangneux JP, Sonneville R, Millon L, Wolff M, Danion F, Paccoud O, Lortholary O, Naggara O, Lanternier F, Serris A. (2026): Multicenter Analysis of General presentations and Imaging features in Cerebral MUCORmycosis (MAGICMUCOR): toward different entities. Med Mycol. 2026 Jan 2;64(1):myaf122.
    • Lang M, Susan V, Brendel L, Sabou M, Bourel-Bonnet L. (2025):Antifungal echinocandins: Historical discovery, comprehensive structure-activity relationships, resistance mechanisms and future developments. Eur J Med Chem. 2025 Dec 15;300:118102.
    • Susan V, Lang M, Sabou M, Bourel-Bonnet L. (2025): Antifungal Drugs for the Treatment of Invasive Fungal Infections-A Limited Therapeutic Toolbox Facing Growing Resistances. Pharmaceuticals (Basel). 2025 Aug 19;18(8):1220.
    • Paccoud O, Lortholary O, Imbert S, Letscher-Bru V, Boukris-Sitbon K, Obadia T, Dalle F, Hasseine L, Morio F, Huguenin A, Poirier P, Favennec L, Bonhomme J, Alanio A, Lanternier F, Desnos-Ollivier M; French Mycoses Study Group. (2025): Yeast fungaemia among injection drug users in France (2012-2022): a cross-sectional observational study. Lancet Reg Health Eur. 2025 Jun 25;55:101365.
    • Ledoux MP, Dicop E, Sabou M, Letscher-Bru V, Castelain V, Danion F, Herbrecht R. (2024) : Fusarium, Scedosporium and other rare mold infections: over 20-five-year experience of a European tertiary-care center. J Fungi (Basel). 0(4):289.
    • Kaeuffer C, Baldacini M, Ruge T, Ruch Y, Zhu YJ, DeCian M, Philouze G, Bachellier P, Denis J, Letscher-Bru V, Lefebvre N, Scheinder F, Hansmann Y, Herbrecht R, Sabou M,
    • Danion F. (2022): Emerging fungal infections due to Kazachstania species. Emerg Infect Dis.
      28(1):29-34.
    • Danion F, Duval C, Séverac F, Bachellier P, Candolfi E, Castelain V, Clere-Jehl R, Denis J, Dillenseger L, Epailly E, Gantzer J, Guffroy B, Hansmann Y, Herbrecht JE, Letscher-Bru V, Leyendecker P, Le Van Quyen P, Ludes PO, Morel G, Moulin B, Paillard C, Renaud-Picard B, Roche AC, Sabou M, Schneider F, Solis M, Talagrand-Reboul E, Veillon F, Ledoux MP, Simand C, Herbrecht R (2021). Factors associated with coinfections in invasive aspergillosis : a retrospective cohort study. Clin Microbiol Infect. S1198-743X(21)00103-8

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